Şüpheli Vakalarda Corona Virüs Hastalığı (COVID-19) İçin Laboratuvar Testi

Yayın Tarihi : 2020/03/29 20:49 • Güncelleme Tarihi : 2020/04/02 19:53 • Yazar: Başak Pırıl Gökayaz

Bu bilgiler, Dünya Sağlık Örgütünün (DSÖ) bilgileri olup hastaların COVID-19 virüs laboratuvar testlerinde yer alan laboratuvarlara ve ilgili kimselere geçici rehberlik sağlar. DSÖ verilerinden Tahlil.com tarafından Türkçe'ye çevrilmiştir.
Kısmen Orta Doğu Solunum Sendromu (MERS) corona virüsü laboratuvar testine ilişkin geçici rehberliğe dayanmaktadır. COVID-19 virüsü ile insan enfeksiyonu hakkında bilgiler ortaya çıkıyor ve DSÖ gelişmeleri izlemeye ve gerektiğinde tavsiyeleri gözden geçirmeye devam etmektedir. Yeni bilgiler mevcut olduğunda bu belge revize edilecektir.Dünya Sağlık Örgütü sizlerden gelecek geri bildirime açıktır. Bildirimleri  [email protected]. adresine yazabilirsiniz. Virüs şimdi Uluslararası Virüs Taksonomisi Komitesi (ICTV) tarafından SARS-CoV-2 olarak adlandırılmıştır. Bu virüs, corona virüs hastalığı 2019 (COVID-19) adlı hastalığa neden olabilir. DSÖ, virüsü mevcut belgelerinde COVID-19 virüsü olarak ifade eder. Dünya Sağlık Örgütünün hazırlamış olduğu Corona Virüs Hastalığı (COVID-19) laboratuvar tanısı için laboratuvar testi bilgilerine dair  belgenin devamını okumanızı öneriyoruz.

Şüpheli Vakalarda Corona Virüs Hastalığı (COVID-19) İçin Laboratuvar Testi

Şüpheli Corona Virüs Hastalığı (COVID-19) Vaka Tanımına Uyanlar İçin Laboratuvar Testi İlkeleri

COVID 19 için laboratuvar testi kararı klinik ve epidemiyolojik faktörlere dayanmalı ve enfeksiyon olasılığının değerlendirilmesiyle bağlantılı olmalıdır. COVID-19 vakası ile temas etmiş olan bireylerin değerlendirilmesinde asemptomatik veya hafif semptomatik temaslarda PCR testi düşünülebilir.
İzleme protokolleri yerel duruma uyarlanmalıdır. Vaka tanımları, yeni bilgiler elde edildikçe düzenli olarak gözden geçirilmekte ve güncellenmektedir. DSÖ'den şüphelenilen vaka tanımı için bakınız: Corona virüs hastalığı olan insan enfeksiyonu için Küresel Gözetim (COVID-2019). COVID-19 için şüphelenilen vaka tanımını karşılayan hastalardan hızlıca numune alınması ve test edilmesi klinik yönetim ve salgın kontrolü için bir önceliktir ve bir laboratuvar uzmanı tarafından yönlendirilmelidir.
Şüpheli vakalar, RT-PCR gibi nükleik asit amplifikasyon testleri (NAAT) ile virüs açısından taranmalıdır.
COVID-19 için test henüz ulusal olarak mevcut değilse, örnekler yönlendirilmelidir. COVID-19 için doğrulayıcı test ve sevkiyat talimatları sağlayan DSÖ referans laboratuvarlarının bir listesi mevcuttur.

Vaka yönetimi gerekiyorsa, hastalar toplum kökenli pnömoni için yerel yönetim kılavuzlarında önerildiği gibi rutin laboratuvar prosedürleri kullanılarak diğer solunum yolu patojenleri için test edilmelidir.
Ek testler COVID-19 testini geciktirmemelidir. Koenfeksiyonlar meydana gelebileceğinden, şüpheli vaka tanımını karşılayan tüm hastalar, başka bir solunum yolu patojeninin bulunup bulunmadığına bakılmaksızın COVID-19 virüsü açısından test edilmelidir. Wuhan'da yapılan erken bir çalışmada, COVID-19 için ortalama kuluçka süresi 425 vaka arasında 5.2 gündü, ancak bireyler arasında büyük farklılıklar göstermektedir.
Virüsün bulaşma şekli henüz tam olarak anlaşılamamıştır ve en uygun şekilde  numune toplama hakkında bilgi vermek için virüsün bulaşma zamanını, yayılmasını ve miktarını daha iyi anlamak için daha fazla araştırmaya ihtiyaç vardır.
Solunum numuneleri en yüksek verime sahip olmasına rağmen, virüs dışkı ve kan da dahil olmak üzere diğer örneklerde tespit edilebilir. Numune toplama, test etme ve potansiyel olarak gelecekteki araştırmalar için bilgilendirilmiş onam ile ilgili yerel kurallara uyulmalıdır.

Corona Virüs Hastalığı (COVID-19) Testi Numune Toplanma Ve Taşınması

Örnek toplama sırasında güvenlik prosedürleri  Yeterli standart yürütme prosedürlerinin (SOPs) kullanımda olduğundan ve personelin uygun numune toplama, saklama, paketleme ve taşıma konusunda eğitildiğinden emin olun.
Laboratuvar incelemeleri için toplanan tüm örnekler potansiyel olarak bulaşıcı olarak kabul edilmelidir.  Örnekleri toplayan sağlık çalışanlarının enfeksiyon önleme ve kontrol kurallarına titizlikle uyduğundan emin olun. Belirli DSÖ geçici rehberleri yayınlandı.

1. Laboratuvarda Biyogüvenlik Uygulamaları

Şüpheli vaka tanımını karşılayan hastalardan alınan klinik örneklerin test edilmesi, ilgili teknik ve güvenlik prosedürleri konusunda eğitilmiş personel tarafından uygun şekilde donatılmış laboratuvarlarda yapılmalıdır.
Her koşulda laboratuvar biyogüvenliği ile ilgili ulusal kılavuzlara uyulmalıdır. COVID-19'un maruz kaldığı risk hakkında hala sınırlı bilgi vardır, ancak tüm prosedürler risk değerlendirmesine dayanarak gerçekleştirilmelidir.
Moleküler test için numune işleme, BSL-2 veya eşdeğer tesisler gerektirir. Virüs kültürü girişimleri en az BSL-3 tesisleri gerektirir.  COVID-19 risk değerlendirmesi ile ilgili daha fazla bilgi için bkz.: DSÖ 2019nCov ile ilgili biyogüvenlik laboratuvar için geçici rehberlik.  Çocuk felci için potansiyel olarak enfeksiyöz materyaller (PIM) olan numunelerin, poliovirüsler için potansiyel olarak enfeksiyöz olan materyalleri toplama, taşıma veya depolama tesisleri için riskleri en aza indirmek amacıyla DSÖ belgesindeki rehberde açıklandığı gibi kullanılması ve saklanması gerekir.

Corona Virüs Hastalığı (COVID-19) Testi İçin Toplanan Numuneler Nelerdir?

Tanı için solunum materyali toplanmalıdır:

Üst solunum örnekleri: Hastalarda nazofaringeal ve orofaringeal sürüntü veya yıkama  örnekleri alınması.

Alt solunum yolu örnekleri: daha şiddetli solunum hastalığı olan hastalarda balgam (varsa) ve/veya endotrakeal aspirat veya bronkoalveoler lavaj. (Yüksek aerosolizasyon riskine dikkat edin; enfeksiyon önleme ve kontrol prosedürlerine kesinlikle uyun).

SARS ve MERS'den sorumlu corona virüslerde olduğu gibi kan ve dışkıda COVID-19 virüsü tespit edildiğinden ek örnekler toplanabilir. COVID-19 virüsünün dışkıda ve potansiyel olarak idrarda bulaşma süresi ve sıklığı bilinmemektedir. Ölen hastalarda, akciğer dokusu da dahil olmak üzere otopsi materyalini  göz önünde bulundurun. Hayatta kalan hastalarda, eşleştirilmiş serum (akut ve iyileşme) serolojik tahliller mevcut hale geldikçe vakaları retrospektif olarak tanımlamak için yararlı olabilir. Asemptomatik bireylerin testi de dahil olmak üzere toplanacak materyallerle ilgili diğer öneriler Tablo 1'de bulunabilir.

Klinik Örneklerin Alınması ve Taşınması

Virüs tespiti için numuneler toplandıktan sonra mümkün olan en kısa sürede laboratuvara ulaşmalıdır. Numune taşınması sırasında numunelerin doğru şekilde kullanılması esastır. Laboratuvara derhal teslim edilebilen numuneler 2-8°C'de saklanabilir ve sevk edilebilir. l
Laboratuvara ulaşan numunelerde gecikme olması muhtemel olduğunda, viral nakil ortamının kullanılması şiddetle tavsiye edilir. Numuneler - 20°C'ye veya ideal olarak -70°C'ye kadar dondurulabilir ve daha fazla gecikmeler bekleniyorsa kuru buz üzerinde sevk edilebilir (bkz.Tablo 2). Örneklerin tekrar tekrar dondurulmasını ve çözülmesini önlemek önemlidir.

Örneklerin ulusal sınırlar içinde taşınması, geçerli ulusal düzenlemelere uygun olmalıdır. Potansiyel olarak COVID-19 virüsü içeren örneklerin uluslararası nakliyesi, BM Model Düzenlemelerine ve kullanılan taşıma şekline bağlı olarak geçerli diğer düzenlemelere uymalıdır. Daha fazla bilgi için DSÖ 2019-2020 Bulaşıcı Maddelerin Taşınması Hakkında Yönetmelik ve corona virüs hastalığına ilişkin laboratuvar biyogüvenliği için DSÖ geçici kılavuzuna bakınız. 

Laboratuvar ile iyi iletişim kurun ve gerekli bilgileri sağlayın.

Numune göndermeden önce laboratuvarı uyarmak, numunelerin doğru ve zamanında işlenmesini ve zamanında raporlanmasını sağlar. Örnekler doğru bir şekilde etiketlenmeli ve bir teşhis talep formu (Ek I'de verilen şablon) ile birlikte verilmelidir.

Tablo 1. Semptomatik hastalardan ve temaslardan toplanacak örnekler

 

Test

Örnek türü

Zamanlama

Hasta

NAAT

Alt solunum yolu-balgam-aspirasyon-lavaj

Üst solunum yolu - nazofaringeal ve - orofaringeal sürüntüler - nazofaringeal yıkama / nazofaringeal aspirasyon.

Dışkı, tam kan, idrar ve hastaysa otopsiden gelen malzemeleri göz önünde bulundurun.

Klinik Prezentasyonda toplayın

Açıklığı izlemek için muhtemelen örnekler tekrar alınır. Tekrarlanan alınan örneklerin etkinliğini ve güvenilirliğini belirlemek için daha fazla araştırma gerekiyor.

Hasta

Seroloji

Serolojik testler için serum onaylı ve hazırdır.

Eşleştirilmiş numuneler, hastalığın ilk haftasında toplanan ilk numunenin doğrulanması için gereklidir ve ikinci ideal olarak 2-4 hafta sonra toplanır (iyileşme örneği için ideal zamanlama oluşturulması gerekir).

Salgınlarla bağlantılı sağlık merkezleri veya semptomları olan ya da semptom olmayıp da COVID-19 vakaları ile iletişim kurup virüse yoğun bir şekilde maruz kalınan yerler ile iletişim kurun.

NAAT

Nazofaringeal ve orofaringeal sürüntüler.

Son belgelenen temasın kuluçka süresi içinde.

 

Seroloji

Serolojik testler için serum onaylı ve hazırdır.

Temas inkübasyon süresi içinde mümkün olduğu kadar erken alınan temel serum ve son temastan 2-4 hafta sonra alınan iyileşme serumu (iyileşme örneği için ideal zamanlama oluşturulmalıdır)


Tablo 2. Numune toplama ve depolama

Numune tipi

Toplama malzemeleri

Ülke içi laboratuarda test edilene kadar depolama sıcaklığı

Beklenen sevkiyat süresine göre sevkiyat için önerilen sıcaklık

Nazofaringeal ve orofaringeal sürüntüler

 

 

Dakron veya polyester sürüntüler

 

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤5 gün -70 °C (kuru buz) eğer >5 gün

Bronkoalveolar

Bronkoalveolar lavaj  

Steril kap*

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤2 gün -70 °C (kuru buz) eğer >2 gün

(Endo) trakeal aspirat, nazofaringeal veya nazal yıkama / aspirasyon

Steril kap*

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤2 gün -70 °C (kuru buz) eğer >2 gün

Balgam

Steril kap

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤2 gün -70 °C (kuru buz) eğer >2 gün

Akciğer dahil olmak üzere biyopsi veya otopsiden doku.

 

Steril kap içinde salin veya VTM 

2-8 °C

 2-8 °C eğer ≤24 saat -70 °C (kuru buz) eğer > 24 saat

Serum 

Serum ayırıcı tüpler (yetişkinler: 3-5 ml kan alınır).

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤5 gün -70 °C (kuru buz) eğer >5 gün

Tam kan

Toplama tüpü

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤5 gün -70 °C (kuru buz) eğer >5 gün

Dışkı

Dışkı kabı

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤5 gün -70 °C (kuru buz) eğer >5 gün

İdrar

İdrar toplama kabı

2-8 °C

2-8 ° C eğer ≤5 gün -70 °C (kuru buz) eğer >5 gün


Viral tespit için örneklerin taşınması için antifungal ve antibiyotik takviyeleri içeren viral taşıma ortamını (VTM) kullanın. Numunelerin tekrar tekrar dondurulmasından ve çözülmesinden kaçının. VTM mevcut değilse, bunun yerine steril salin kullanılabilir (bu durumda, 2-8 °C'de numune saklama süresi yukarıda belirtilenlerden farklı olabilir).

Tabloda belirtilen özel toplama malzemelerinin yanı sıra, diğer malzemelerin ve ekipmanların da mevcut olduğundan emin olun: ör. taşıma kapları ve örnek toplama torbaları ve ambalajları, soğutucular ve soğuk paketler veya kuru buz, steril kan alma ekipmanı (örn. iğneler, şırıngalar ve tüpler), etiketler ve kalıcı kalemler, PPE, yüzeylerin temizlenmesi için malzemeler, vb.

Kaynak: https://apps.who.int/iris/handle/10665/331329

Bu konuya dair bir sorunuz varsa siz de uzmanlarımıza 7/24 Soru sorabilirsiniz.Soru sormak için tıklayın.




Bu Makale Uz.Dr. Cem Argun Tarafından Gözden Geçirilmiştir.

Yorumlar

Yorum
?